非營利事業在收到捐款後並不是這樣就結束了，通常處理後續事項比收捐款時有更多繁瑣的事情要處理，像是款項的用途、捐款者的收據、義賣品的寄送 等等。
在非營利事業中的募款分為二類：
1、常態募款，需要在組織章程條款中註明，做為長期的事工所用。
2、活動勸募，需要透過內政部社會局的通過，並在內政部社會司公益勸募管理系統能查詢到的勸募活動。
這二類的募款活動的款項管理上是有些不同，如何針對這二類的捐款收支做妥善的管理，是每個非營利事業重要的課題。
捐款者的收據開立也是一大學問，收據有分為年底總捐款額的收據(包含捐款明細)或單次的收據，如何管理這二種收據開立，不重複開立捐款項目(金額)，都要有系統協助檢查及開立，以確保其正確性。收據除了一般開立之外，也要有補發之功能，補發之收據除了要確定是補發外，補發次數及加蓋補發章在收據上也是需要特別細心並且留意。
系統功能：
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款項管理：分為常態募款、活動勸募二種，做為妥善支出管理。
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認養配對：針對長期有認養目標及對象，像是 兒童、流浪動物等等，針對認養人及被認養人(動物)做1對1的配對。
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收據管理：收據開立及寄送管理。
捐款管理系統詳細圖說：
捐款管理系統的特色有以下3點：1、款項管理：可有效管理各活動之帳務。2、認養配對：可針對認養人及被認養人做1對1的配對。3、收據管理：收據開立及寄送管理。
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